Las actividades de vinculación más relevantes que tiene el programa de doctorado han sido el intercambio académico y la movilidad de estudiantes y profesores, así como la impartición de asignaturas y conferencias o ponencias con universidades tanto nacionales como internacionales. Los proyectos de investigación con financiamiento de organismos internacionales tienen una aplicación inmediata en el fortalecimiento de los valores culturales, particularmente en la conciencia de sustentabilidad. Así mismo, los proyectos de interés gubernamental que benefician directamente a un segmento de la población con la reactivación de zonas en abandono.

Ejemplos de ello lo tenemos la participación del Dr. Marco Tulio Peraza Guzmán en el Proyecto denominado Plan Maestro la Plancha 2016 en el que participaron la FAUADY, El Gobierno del Estado de Yucatán y el CIESAS UNAM. Así mismo, se tiene el proyecto de investigación denominado Vivienda popular como unidad doméstica sustentable: medio ambiente y cultura en la localidad de Plan Chac en el municipio de Sacalum, Yucatán, realizado por la Dra. Lucía Tello Peón entre los años 2013 y 2014, financiado por el programa Pequeñas Donaciones de Naciones Unidas.